Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CUL4BQ13620 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CUL4BQ13620 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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