Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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