Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AL157871.5-201ENST00000555212 533 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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