Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XRCC4Q13426 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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