Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3BPQ13352 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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