Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SKP2Q13309 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SKP2Q13309 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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