Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR1H3Q13133 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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