Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MKRN3Q13064 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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