Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWF1Q12792 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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