Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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