Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms