Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LOXL1Q08397 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms