Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DHX9Q08211 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms