Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXM1Q08050 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms