Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms