Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PAX8Q06710 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms