Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTDSPL2Q05D32 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms