Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms