Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A3Q01959 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms