Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BNC1Q01954 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms