Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms