Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HSF1Q00613 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms