Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPS4XP62701 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms