Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms