Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA9P57773 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA9P57773 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA9P57773 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms