Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB38P57729 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms