Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CASP6P55212 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP6P55212 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP6P55212 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms