Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HIRAP54198 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HIRAP54198 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HIRAP54198 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HIRAP54198 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIRAP54198 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms