Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms