Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms