Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPOP42166 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPOP42166 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms