Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR1BP42025 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms