Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACVR1BP36896 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACVR1BP36896 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms