Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
THBS4P35443 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
THBS4P35443 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
THBS4P35443 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
THBS4P35443 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms