Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TCEA1-206ENST00000520534 635 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC005050.1-201ENST00000591803 550 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXD11P31277 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC073911.1-202ENST00000443154 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CNTNAP3P5-201ENST00000611892 888 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC026401.3-201ENST00000624682 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SLC3A1-208ENST00000410056 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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