Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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