Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CMPK1P30085 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms