Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCAP28676 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCAP28676 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCAP28676 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCAP28676 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCAP28676 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCAP28676 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCAP28676 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCAP28676 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms