Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTX3P26022 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTX3P26022 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTX3P26022 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTX3P26022 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms