Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO1P25800 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LMO1P25800 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LMO1P25800 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LMO1P25800 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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