Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms