Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2AP24928 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms