Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1P21675 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1P21675 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1P21675 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF1P21675 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF1P21675 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF1P21675 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF1P21675 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms