Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRHP20396 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRHP20396 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRHP20396 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRHP20396 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TRHP20396 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRHP20396 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRHP20396 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms