Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFE3P19532 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms