Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PTPRAP18433 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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