Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTRB1P17538 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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