Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD46P15529 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD46P15529 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD46P15529 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms