Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms