Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH1P12830 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH1P12830 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH1P12830 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms